Genome sequence resource for Xanthomonas oryzae pv. oryzae (causal agent of bacterial leaf blight of rice) isolated from Pakistan

Abstract: Bacterial leaf blight, one of the most destructive diseases of rice, is prevalent in the major rice-growing regions of the world. Bacterial leaf blight is caused by Xanthomonas oryzae pv. oryzae (Xoo) and greatly affects the quantity and quality of the rice crop. We sequenced the whole genome of Xoo isolated from a Basmati rice-growing region of Pakistan using long-read Oxford Nanopore sequencing technology. About 637 MB of data was retrieved, corresponding to 133× genome sequencing coverage. The final assembly yields a circular chromosome of 4,930,682 bp. The complete genome of the Xoo isolate from Pakistan will enhance sequence resources for global comparison of Xoo diversity across the region

Standort
Deutsche Nationalbibliothek Frankfurt am Main
Umfang
Online-Ressource
Sprache
Englisch
Anmerkungen
PhytoFrontiers. - 3, 3 (2023) , 731-733, ISSN: 2690-5442

Ereignis
Veröffentlichung
(wo)
Freiburg
(wer)
Universität
(wann)
2024
Urheber
Ejaz, Khansa
Zakria, Muhammad
Tapia, Jose Huguet
Zhang, Peiqi
Faiq, Ali
Ahsan, Rafia
ʿĀrif, Muḥammad Āṣif
Asif, Muhammad
White, Frank F.
Yasmin, Sumera

DOI
10.1094/phytofr-12-22-0148-a
URN
urn:nbn:de:bsz:25-freidok-2549476
Rechteinformation
Open Access; Der Zugriff auf das Objekt ist unbeschränkt möglich.
Letzte Aktualisierung
25.03.2025, 13:52 MEZ

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Beteiligte

  • Ejaz, Khansa
  • Zakria, Muhammad
  • Tapia, Jose Huguet
  • Zhang, Peiqi
  • Faiq, Ali
  • Ahsan, Rafia
  • ʿĀrif, Muḥammad Āṣif
  • Asif, Muhammad
  • White, Frank F.
  • Yasmin, Sumera
  • Universität

Entstanden

  • 2024

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