Arbeitspapier

The R-Package surveillance

This document gives an introduction to the R-Package 'surveillance' containing tools for outbreak detection in routinely collected surveillance data. The package contains an implementation of the procedures described by Stroup et al. (1989), Farrington et al. (1996) and the system used at the Robert Koch Institute, Germany. For evaluation purposes, the package contains example data sets and functionality to generate surveillance data by simulation. To compare the algorithms, benchmark numbers like sensitivity, specificity, and detection delay can be computed for a set of time series. Being an open-source package it should be easy to integrate new algorithms; as an example of this process, a simple Bayesian surveillance algorithm is described, implemented and evaluated.

Sprache
Englisch

Erschienen in
Series: Discussion Paper ; No. 422

Thema
infectious disease
monitoring
aberrations
outbreak
time series of counts

Ereignis
Geistige Schöpfung
(wer)
Höhle, Michael
Riebler, Andrea
Ereignis
Veröffentlichung
(wer)
Ludwig-Maximilians-Universität München, Sonderforschungsbereich 386 - Statistische Analyse diskreter Strukturen
(wo)
München
(wann)
2005

DOI
doi:10.5282/ubm/epub.1791
Handle
URN
urn:nbn:de:bvb:19-epub-1791-2
Letzte Aktualisierung
10.03.2025, 11:44 MEZ

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Objekttyp

  • Arbeitspapier

Beteiligte

  • Höhle, Michael
  • Riebler, Andrea
  • Ludwig-Maximilians-Universität München, Sonderforschungsbereich 386 - Statistische Analyse diskreter Strukturen

Entstanden

  • 2005

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