Bisulfite-free epigenomics and genomics of single cells through methylation-sensitive restriction
Abstract: Single-cell multi-omics are powerful means to study cell-to-cell heterogeneity. Here, we present a single-tube, bisulfite-free method for the simultaneous, genome-wide analysis of DNA methylation and genetic variants in single cells: epigenomics and genomics of single cells analyzed by restriction (epi-gSCAR). By applying this method, we obtained DNA methylation measurements of up to 506,063 CpGs and up to 1,244,188 single-nucleotide variants from single acute myeloid leukemia-derived cells. We demonstrate that epi-gSCAR generates accurate and reproducible measurements of DNA methylation and allows to differentiate between cell lines based on the DNA methylation and genetic profiles
- Location
-
Deutsche Nationalbibliothek Frankfurt am Main
- Extent
-
Online-Ressource
- Language
-
Englisch
- Notes
-
Communications biology. - 4, 1 (2021) , 153, ISSN: 2399-3642
- Event
-
Veröffentlichung
- (where)
-
Freiburg
- (who)
-
Universität
- (when)
-
2021
- Creator
- DOI
-
10.1038/s42003-021-01661-w
- URN
-
urn:nbn:de:bsz:25-freidok-1942528
- Rights
-
Der Zugriff auf das Objekt ist unbeschränkt möglich.
- Last update
-
14.08.2025, 11:03 AM CEST
Data provider
This object is provided by:
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Time of origin
- 2021
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