Arbeitspapier

Secondary structure classification of amino-acid sequences using state-space modeling

The secondary structure classification of amino acid sequences can be carried out by a statistical analysis of sequence and structure data using state-space models. Aiming at this classification, a modified filter algorithm programmed in S is applied to data of three proteins. The application leads to correct classifications of two proteins even when using relatively simple estimation methods for the parameters of the state-space models. Furthermore, it has been shown that the assumed initial distribution strongly influences the classification results referring to two proteins.

Sprache
Englisch

Erschienen in
Series: Technical Report ; No. 2001,49

Thema
Secondary structure classification
discrete state-space models
filtering

Ereignis
Geistige Schöpfung
(wer)
Brunnert, Marcus
Krahnke, Tillmann
Urfer, Wolfgang
Ereignis
Veröffentlichung
(wer)
Universität Dortmund, Sonderforschungsbereich 475 - Komplexitätsreduktion in Multivariaten Datenstrukturen
(wo)
Dortmund
(wann)
2001

Handle
Letzte Aktualisierung
10.03.2025, 11:41 MEZ

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Objekttyp

  • Arbeitspapier

Beteiligte

  • Brunnert, Marcus
  • Krahnke, Tillmann
  • Urfer, Wolfgang
  • Universität Dortmund, Sonderforschungsbereich 475 - Komplexitätsreduktion in Multivariaten Datenstrukturen

Entstanden

  • 2001

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