Integration of biological molecular data into an existing drug therapy safety workflow used in hospital information systems

Abstract: In the last few decades, precision medicine became a highly weighted subject as the risk of side effects grew with the increasing drug use. The mass of evolving pharmacogenetic data invites to establish a preemptive genotyping approach and the integration of those molecular data into the workflow of an existing hospital information system to improve the safety of drug therapy. The newly introduced software module GraphSAW2-DWHBuilder creates the graph-based data warehouse. For that, molecular data from various sources is assembled in a graph database. Furthermore, an update strategy was developed to ensure that only the latest version of the data is used. To eliminate redundancies and to guarantee efficient querying, a mapper strategy was established. Another new module named GraphSAW2-Check is embedded in an existing drug therapy safety workflow used in hospitals. It contains methods for the pharmacogenetic check, which access the molecular data warehouse of the GraphSAW2-DWHBuil...
Abstract: In den letzten Jahrzehnten wurde die Präzisionsmedizin zu einem hoch gewichteten Thema, da das Risiko von Nebenwirkungen mit dem zunehmenden Medikamentenkonsum zunahm. Die stetig zunehmenden pharmakogenetischen Forschungsdaten ermöglichen einen präventiven Ansatz zur Genotypisierung im Krankenhaus und die Integration dieser molekularen Daten in den Medikationscheck eines bestehenden Krankenhausinformationssystems zu etablieren, um die Sicherheit der Arzneimitteltherapie zu verbessern. Das neu eingeführte Softwaremodul GraphSAW2-DWHBuilder erstellt das graphbasierte Data Warehouse. Dazu werden molekulare Daten aus verschiedenen Quellen in einer Graphdatenbank zusammengeführt. Darüber hinaus wurde eine Strategie entwickelt, die die Daten aktuell hält, um sicherzustellen, dass für den pharmakogenetischen Medikationscheck nur die neueste Version der Forschungsdaten verwendet wird. Um Redundanzen zu eliminieren und eine effiziente Abfrage zu gewährleisten, wurde zudem eine Mapper-Strat...

Object Details

• Alternative title: Integration molekularer Daten in den Therapiesicherheits-Workflow eines bestehenden Krankenhausinformationssystems
• Location: Deutsche Nationalbibliothek Frankfurt am Main
• Extent: Online-Ressource
• Language: Englisch

References and Relationships

• Bibliographic citation: Integration of biological molecular data into an existing drug therapy safety workflow used in hospital information systems ; volume:19 ; day:04 ; month:07 ; year:2023 ; GMS Medizinische Informatik, Biometrie und Epidemiologie ; 19 (04.07.2023)

Classification and Topics

• Classification: Medizin, Gesundheit

Contributors, Places and Time

• Creator: Raupach, Lena

Further information

• DOI: 10.3205/mibe000242
• URN: urn:nbn:de:0183-mibe0002422
• Rights: Open Access; Der Zugriff auf das Objekt ist unbeschränkt möglich.
• Last update: 14.08.2025, 10:59 AM CEST